深度学习 A to Z · 果蝇特别篇 3

仅凭接线图运转的果蝇,走进了 Minecraft

这只果蝇什么也不学。它只是把雄性果蝇神经系统的真实接线图原样搬过来,把每个神经元当作发出电脉冲的简单零件来运行。可是,它尝到糖会伸出口器,混入苦味就停下,有东西扑过来就跳起。如果说前两页讲的是“像大脑的神经网络如何学习”,那么这一页提出相反的问题:不学习,只靠连接,能产生行为吗?

对象:github.com/blendi-remade/fly-brain-minecraft(Fabric 模组,Minecraft 1.21.1)。本页的数字均出自模组仓库的文档(README、docs/VALIDATION.md)。正文中带点状下划线的词语,悬停或点击即可看到释义。

176,422模拟的神经元数 [1]
629万连接数(仅含 5 个以上突触的连接) [1]
9,030万这些连接包含的突触数 [1]
1,769接收游戏画面的视网膜柱 [2]
50 ms游戏每 1 tick 流过的大脑时间 [2]
0 个通过学习改变的权重 [2]

这个游戏做了什么 —— 把三种素材拼在一起

在 Minecraft 里放入一只果蝇生物,并在它的脑袋里完整运行真实的果蝇神经系统。生物看到、闻到、尝到的东西会刺激真实的感觉神经元,再读取真实的下行神经元和运动神经元的活动来驱动生物移动。每只果蝇都在自己的线程中实时运行自己的大脑。

素材 1 · 接线图雄性果蝇整个神经系统的连接组

包括大脑和腹神经索(相当于昆虫的脊髓)在内的整个中枢神经系统。使用了 2026 年 9 月 3 日发表于 Cell 的 Berg 等人论文的公开数据(neuPrint male-cns:v1.0)。这个模组在论文发表当天就做出来了。

素材 2 · 神经元模型所有神经元都用同一个“泄漏积分发放”零件

完全沿用了 Shiu 等人(2024)Nature 模拟整个果蝇大脑时的方法。没有为单个神经元单独调的参数,连接的突触数就是连接强度。

素材 3 · 身体与世界Minecraft 世界与生物的身体

苹果·蛋糕·蜘蛛眼·雨·扑过来的玩家成为感觉输入,大脑下达的命令变成行走·进食·跳跃·梳理等生物动作。这部分是人工手动制作的。

Minecraft 画面:正在飞行的果蝇生物,左侧是神经系统地图,右侧是神经示波器面板
真实游戏画面。中间是果蝇生物(Fly-1 ♂),左侧是 B 键“脑图”(上:视叶与大脑,下:腹神经索),右侧是 H 键“神经示波器”(运动通道、神经元群发放频率、每 tick 脉冲、视网膜)。下面的行为观察部分就是仿照这个面板做的。
用彩色玻璃方块搭建的连接组结构:左边是大脑,右边是腹神经索
用方块搭建的连接组。/flybrain build 命令会把细胞体位置已重建的 141,781 个神经元,按脑区用不同颜色的玻璃方块搭起来。当连接的生物的神经元发放时,对应方块会以海晶灯闪亮。

图片:fly-brain-minecraft 仓库 docs/media(MIT License,© 2026 Blendi Remade / fal.ai)。仅缩小了尺寸。Minecraft 是 Mojang/Microsoft 的商标。

一句话总结

如果说前两页把“用经验修改连接强度”视为神经网络的核心,那么这个模组实验的是“把连接强度原样从接线图搬来,能做到什么程度”。没有学习,人为设定的数字也很少。最重要的是乘在所有连接上的全局增益 0.65,此外还有 Kenyon 细胞输入 0.25 倍,以及“去掉突触少于 5 个的连接”这一标准。

这个游戏参考的果蝇研究

按作用分组整理了仓库 README 和参考文档(REFERENCE.md)中引用的研究。核心是两篇:连接了什么由 Berg 等人(2026)决定,怎么运行由 Shiu 等人(2024)决定。

核心 ① · 接线图

Berg 等人(2026)雄性果蝇完整中枢神经系统连接组

把大脑和腹神经索拍成一套电子显微镜图像,连起了所有神经元和突触。这也是首次在突触层面比较雄性与雌性大脑的研究。

Cell 189(18):5504–5526 · doi:10.1016/j.cell.2026.08.015

核心 ② · 神经元模型

Shiu 等人(2024)果蝇全脑计算模型

把 FlyWire 雌性大脑接线图中的所有神经元都当作泄漏积分发放零件运行,预测了“尝到糖 → 伸出口器”等感觉-运动通路,并用实验加以验证。模组的神经元公式和数值完全照搬这篇论文。

Nature 634:210–219 · doi:10.1038/s41586-024-07763-9

数据工具

Plaza 等人(2022)neuPrint

用于查询连接组的公开工具。模组中的神经元名称(DNp01、MN9 …)全都是 neuPrint 的细胞类型名,因此可以直接在网页上查到画面里的神经元。

Front. Neuroinform. 16:896292

感觉方面的配套论文

视觉系统 · 味觉连接组

Nern 等人(2025)的视觉系统完整目录、Hoeller 等人(2026)的视觉通路、Tastekin 等人(2026)的味觉-摄食连接组。用于决定把游戏输入送进哪些感觉神经元。

Nature 641 · Cell 189(18) 两篇

运动方面的依据

下行神经元与行为

行走·停止(Sapkal 2024)、转向(DNa02)、巨纤维与逼近逃逸(von Reyn 2014,Ache 2019)、着陆(Ache 2019)、触角梳理(Hampel 2015)、振翅强度(Namiki 2022)。这些是把神经元活动解读为生物动作的规则依据。

Nature · Nat Neurosci · eLife · Curr Biol

腹神经索 · 性别回路

MANC 连接组与性二态回路

Takemura 等人、Marin 等人(2024)、Cheong 等人(2026)的雄性腹神经索研究,以及 Rubin 等人(2026)的雄性特有神经元(pC1、P1)研究。它们是求偶鸣唱连接的基础,但这一功能尚未演示。

eLife 13 · Curr Biol (2026)

数字略有不同的原因。论文摘要把完成校对的神经元计为 166,700 个。模组则模拟从 neuPrint 数据集载入的全部 176,422 个条目,并把其中细胞体位置已重建的 141,781 个搭成方块结构。差异应是计数标准不同所致。

与前几页的关系。第 ① 页引用的 FlyWire(2024)连接组,正是 Shiu 等人(2024)使用的那份雌性大脑接线图。本模组把同样的方法搬到了更大的雄性神经系统(大脑 + 腹神经索)上。

从大脑到腹神经索 —— 游戏中信号走过的路

在前一页的 3D 大脑上加了腹神经索(下方细长的一团)、颈部和口器。因为这个模组运行的不只是大脑,还包括驱动腿和翅膀的运动神经元。选择场景后,绿色信号会沿真实的连接通路前进。这是示意模型,不是真实解剖数据。

场景

脑区说明

单个神经元的计算 —— 往漏水的桶里倒水

17 万个神经元全都是这一个零件。输入脉冲到来时电压升高,放着不管就会漏回静息电压。超过阈值(−45 mV)就发出脉冲,随即回到 −52 mV。这就是在第 ① 页的“超简单模型” y = [w·x ≥ θ] 上加入了时间和泄漏。

输入神经元的发放频率
单个连接的突触数
全局增益
第 ① 页的人工神经元

把输入 × 权重相加,超过阈值为 1,否则为 0。没有时间,输入一到就立刻出结果。权重通过学习确定。

本模组的泄漏积分发放神经元

输入随时间累积,又慢慢漏走。所以“多频繁、多集中”地输入很重要。权重固定为接线图的突触数 × 0.275 mV × 增益 0.65。

兴奋与抑制如何决定 —— 符号也来自接线图

根据神经元释放的神经递质决定连接的符号。乙酰胆碱·多巴胺·血清素等为兴奋(+),GABA·谷氨酸·组胺为抑制(−)。一个神经元的所有输出符号相同(戴尔原理)。结果是兴奋性 116,390 个、抑制性 60,032 个。第 ① 页总结表中的“抑制性突触是负权重”,在这里直接由接线图决定。

行为观察仪表盘 —— 施加刺激、观察神经元、读出行为

仿照模组的“神经示波器”(H 键)画面。选择场景后,感觉神经元受到刺激,经过中间神经元,下行·运动神经元的发放频率再经过解码器的优先级阶梯变成行为。条形上的浅色带是仓库验证记录(VALIDATION.md)中的实测范围。

场景
Minecraft 世界→ 感觉神经元 · 泊松脉冲→ 大脑 · 50 ms 计算→ 下行·运动神经元发放→ 解码器 · 优先级→ 生物的行为

神经元群的发放频率(Hz)

解码器的优先级阶梯(越靠左越强)

解码器如何选择行为

把神经元群的发放频率相加,构成 21 个命令通道(前进、转向、后退、停止、跳跃、进食、梳理 …)。两个以上同时开启时,按逃逸 > 着陆 > 飞行 > 急停 > 停止 > 后退 > 前进 > 进食 > 梳理 > 鸣唱的顺序胜出。一旦进入某个行为,至少保持 250 ms,降到阈值的一半以下才会退出。哪些神经元被激活由接线图决定,但这个阶梯和阈值是人定的。

最重要的调节旋钮 —— 校准全局增益

Shiu 等人每个突触 0.275 mV 的取值是针对雌性大脑(FlyWire)调好的。雄性神经系统每个神经元的突触更多,直接沿用这个值会让整个网络过度兴奋。因此用与论文相同的方法,重新校准了乘在所有连接上的那一个增益。

增益
在本模组中

在满足以下三个条件的值中选了最小的增益:① 糖输入能可靠地激活口器运动神经元;② 梳理·逃逸通路稳定;③ 学习中枢的 Kenyon 细胞保持安静。0.55 时进食偏弱,0.75 时失控。

放到深度学习里来说

相当于不动单个权重,而是通过验证实验挑选初始化尺度之类的超参数。Kenyon 细胞的 0.25 倍也相当于只乘在特定层上的校正值。增益太大时,激活值逐层膨胀而“失控”,这一点也与深层神经网络相同。

哪些来自接线图,哪些是人做的

这个仓库最好的一点是它自己划清了界线。README 写道:“这个项目的核心是对最后一栏(来源)保持诚实。”每种行为都标注了涌现(从接线图中自然产生)、手工(人做的替身)或混合。

注意“涌现”的范围。这里的涌现指“在这个计算机模型中无需规则就出现了”。这不是在真实雄性果蝇身上确认的结果,而是不开游戏、只运行模型的自动测试(bench)的结果。其中部分通路(糖 → MN9、梳理)曾由 Shiu 等人(2024)用雌性大脑模型预测,并通过动物实验得到确认。

行为游戏中的触发接线图中的通路来源
从接线图中自然产生的

哪种感觉模式激活哪些下行·运动神经元 · 苦味在运动前一级关掉进食 · 左右转向的不对称 · 前进/后退行走的相互对抗 · 巨纤维单个脉冲就决定跳跃 · 选择梳理的部位

人做的替身

视网膜绘制与亮度适应 · 气味地图与距离衰减 · 把发放频率换算成方块/秒的倍率 · 阈值与优先级阶梯 · 飞行·着陆物理 · 把逼近信号直接送入 LC4·LPLC2 · Kenyon 细胞输入 0.25 倍 · 朝气味方向行走的反射层

已知局限(仓库文档)。所有神经元使用相同参数 · 闻到气味时触角叶饱和,没有方向信号 · 髓质的运动通路(T4·T5)保持安静 · 没有神经调质·神经肽·电突触·自发活动 · 去掉了突触少于 5 个的连接 · 雌性也使用雄性大脑 · 不要相信发放频率的绝对值,只看哪些神经元群有反应的模式。

迁移应用 —— 用其他 AI 对照这个模组的设计

这个模组是脑科学项目,但它的设计方式与当今的 AI 系统有很多相似之处。我们为学习或教授生成式 AI 的人、以及想把 AI 引入实际工作的人整理了对应关系。

放到生成式 AI 里来说

迁移到自己的系统 —— 如果你的场景混用规则和学习

类比的局限。大语言模型的权重不是人设计的,而是从数据中学来的;这个模组的权重则是测量真实动物的接线得到的。两者只是在“用固定权重只做推理”这一表面上相同,权重的来源却恰恰相反。优先级阶梯也不同于智能体的工具选择,它不理解语言,只比较发放频率的大小。

三项工作比较 —— 同一只果蝇,不同的问题

第 ① 页是神经网络入门,第 ② 页是记忆提取论文图解,再加上这个 Minecraft 模组。三者都沿着“感觉 → 大脑 → 行为”展开,但哪些部分保持真实、哪些部分做了简化各不相同。

三项工作的位置

选择重叠的主题

如何读左边的地图

横轴是在多大程度上原样使用真实接线图,纵轴是用经验修改连接在多大程度上处于核心。前两页位于左上,模组位于右下。右上,即在真实接线图上进行学习的模型,是刚刚起步的领域。代表性的例子是 Lappalainen 等人(2024)Nature:他们保留了果蝇视觉系统运动通路中 64 种细胞类型的真实连接,只用深度学习训练未知的神经元·突触参数。该模型的预测与 26 项研究的实测结果吻合。这正是本模组中保持安静的那条通路(T4·T5)。不过,同时运行整个大脑和身体、又加入学习·神经调节的模型目前还没有。

逐项比较表

共同点

不同点

模型结构比较 —— 本页模型 vs MLP · RNN · GRU · LSTM · CNN

点击按钮切换六种结构的示意图。绿线是可学习的连接,虚线是固定的连接,橙色箭头是跨越时间的记忆。所有图都是展示原理的示意图。

六种结构一览比较

可学习连接 / 全部连接(输入 16×16,3 个类别)

灰色条 = 全部连接,彩色条 = 可学习的连接。深度学习模型全部可学习,果蝇模型大部分是固定连接。下面的训练器和公共部分 A 的代码 2 统计的是同样的数字。

最后一行的证据级别:真实回路·测量 模型搬用了真实回路 · 结构相似 指连接形态相似,并不证明进行相同的计算 · 松散类比 · 纯粹类比 只是帮助解释的说法,没有生物学依据。

从本页视角看的核心差异

表中与本模型最相似的,出人意料地是 RNN。两者都运行时间循环,都有反馈连接。决定性的差别在于权重的来源:RNN 从随机值开始,通过反向传播学习;本模型直接使用电子显微镜测得的接线。介于两者之间的是 Lappalainen 等人(2024)的方法:接线用测量值,只用深度学习训练未知的参数。

果蝇训练器 —— 用自己的画来教,马上试用

像 Teachable Machine 一样:① 为每个类别收集示例,② 训练,③ 用新输入检验。所有计算都在这个浏览器里进行,画作和摄像头影像不会外传。想用代码运行同一模型,请使用公共部分 A 的代码 2。

① 收集数据
② 训练
模型
轮数30 轮
学习率0.05
③ 预览
输入
导出
接着看代码 2 →
导入 · 保存

收集的样本会自动保存在这个浏览器中,刷新后也不会丢失。导出的数据·模型 JSON 可以再次导入。

开始:点击“填入示例数据”,或者在画板上画好后点击类别里的“添加图画”。名称可以点击修改。

与 Teachable Machine 的相同点

创建类别 → 收集样本 → 训练 → 实时预览 → 导出的流程,摄像头输入,以及所有计算都在浏览器中完成。

不同点

Teachable Machine 采用迁移学习:在大型图像模型(MobileNet)预先提取的特征上只训练一个小分类器。这个训练器则由本页的模型从零开始学习 16×16 的图画。因此它适合简单的形状,不擅长照片之类的复杂输入。作为交换,它会如实显示验证准确率和可学习连接的数量。

一页总结

前两页展示了什么

借用大脑原理的人工神经网络通过用经验修改连接强度来解决问题。果蝇的蘑菇体也用多巴胺改变连接,把气味与结果配对,而这段记忆要经过本能回路(侧角)才变成行为。

这个模组展示了什么

把连接强度原样从接线图搬来,即使不学习,进食·拒绝苦味·跳跃·梳理也会从正确的神经元中产生。反过来,像循着气味走这样需要学习·调节的部分,目前仍由人做的替身负责。

要点 1. 仅凭结构(接线)就能产生许多行为。果蝇的许多先天行为就刻写在连接本身之中。

要点 2. 学习与记忆(蘑菇体、多巴胺)是这个模组留空的格子。Kenyon 细胞被刻意保持安静,也没有神经调质。第 ② 页的记忆提取回路正是这个空格。

要点 3. 三项工作都标明了“哪些是真的”:页面用黄色印章,模组用涌现/手工标记。这是通俗地展示科学时最重要的习惯。

Colab 代码 —— 亲手运行本页内容

两段代码都只使用 Colab 预装的库。点击“下载笔记本(.ipynb)”后在 Colab 中通过文件 → 上传笔记本打开,或者复制后粘贴到新笔记本的单元格中。

代码 1 · 用 NumPy 实现由接线图固定的泄漏积分发放网络对应“单个神经元”“行为观察”部分 · numpy · CPU 不到 1 秒

用突触数 × 0.275 mV × 增益 0.65 构造固定权重(符号由神经递质决定),以 120 Hz 刺激 20 个感觉神经元,每步 0.5 ms,计算 100 步。没有任何需要学习的权重。想换成自己的数据,就从真实的连接组文件中读取 syn(突触数矩阵)。

运行结果(2026-10-04 运行,numpy 2.4 · CPU)。固定了随机种子,任何时候运行结果都相同。
代码 2 · 用 PyTorch 比较五种常规深度学习模型与三种果蝇模型对应“实践:结构比较·训练器” · torch、numpy、matplotlib · CPU 约 1 分钟

用同一套图画数据训练 MLP·CNN·RNN·GRU·LSTM 和三种果蝇模型。固定接线脉冲网络模型(ConnectomeLIF)固定 160 个隐藏神经元的连接,只训练解码层。第 8 个单元格绘制脉冲记录。

运行结果(2026-10-04 运行,PyTorch 2 · numpy 2.4 · CPU)。用两个种子分别训练。数字可能因种子·版本·硬件而变化。

与常规深度学习代码有何不同

项目代码 1(固定接线脉冲网络)常规深度学习代码
权重来源电子显微镜测得的突触数 × 0.275 mV × 增益从随机值开始学习
学习无(只有增益 0.65 等少数几个值由人校准)用替代梯度训练所有连接
脉冲的导数不需要(因为不学习)阶跃函数梯度为 0 → 用替代梯度绕过
时间处理0.5 ms × 100 步 = 游戏 1 tick20 步时间循环 + 随时间反向传播
规模17.6万神经元、629万连接(示例为 500 个)通常为数百~数千个神经元
目的预测·解释真实大脑会做什么任务性能(准确率)
输出解读人做的解码器(优先级阶梯)输出层直接就是类别得分
查看用于比较的常规深度学习代码(snn_surrogate_gradient.py,PyTorch)

AI 应用提示词 —— 以这段代码为起点

这是可以粘贴到 ChatGPT、Qwen、Claude 等 AI 助手中的提示词。点击“复制”,所选代码会附在提示词后面一起复制。把〔 〕中的内容换成你自己的情况即可。

附带的代码

AI 的回答只是起点。它建议的论文·数值·库函数,务必对照原文和官方文档核实。如果在竞赛·论文中借助了 AI,请按照主办方和期刊的规定说明使用情况和范围。

术语表

与正文中黄色点状下划线是同一套词典。悬停或点击下划线也会显示相同的解释。

类比合集 —— 以及类比失效之处

类比是理解的第一步,也可能是误解的种子。果蝇·大脑类比标注了强度:直接 有证据表明确实做同样的事 · 部分 只有部分性质相似 · 无 尚不知道对应的东西

概念日常类比果蝇·大脑类比类比失效之处
泄漏积分发放往漏水的桶里倒水:满了就倒空,再重新装直接真实神经元的膜电压也是随输入累积、又不断泄漏,到达阈值就发放脉冲真实神经元的形态和离子通道多种多样,而这个模型让所有神经元都使用同一组数值
接线图 = 预训练权重拿着别人画好的地图,只负责找路部分直接把电子显微镜测得的突触数用作连接强度生成式 AI 的权重是用数据训练出来的,而接线图是测量出来的。两者来源正好相反
增益校准转动音响上唯一的总音量旋钮无真实的大脑里并没有一个总增益旋钮。这个值是人为设定的,用来适配雄性神经系统
反射层(替身)自动驾驶犹豫时,人类接过方向盘无反射层不是生物回路,而是人写的规则。画面上的 [REFLEX] 标记会提示这一时刻
涌现每只蚂蚁都很简单,整个蚁巢却能做出复杂的行为部分没有写入任何规则,进食和逃跑却从接线图中出现了“涌现”是这个模型内部的结果,并没有在真实的雄性果蝇身上验证过

作者介绍与参考文献

E-1 作者介绍 · E-2 学术参考文献 · E-3 图片参考资料

E-1 作者介绍

Sangsun Ahn(M-Robo 公司代表)

曾任职于韩国电气安全公社(Korea Electrical Safety Corporation)和《每日经济新闻》(Maeil Business Newspaper),之后创办了每日经济的外部创业公司 M-Robo,现任代表。M-Robo 起步于媒体公司的内部创业项目,是一家媒体创业企业,曾为《国民日报》(Kookmin Ilbo)提供机器人记者(StockBot)服务,并为韩国互联网振兴院(KISA)、韩国言论振兴财团(Korea Press Foundation)、韩国广播通信电波振兴院(KCA)等机构执行了多个项目。目前运营自有的 AI 新闻媒体 Money-Robo。任代表期间,曾获亚洲开放数据黑客松冠军,并因在数据创业领域的贡献两次获得韩国行政安全部(Ministry of the Interior and Safety)长官奖;拥有人工智能和区块链领域的 5 项发明专利。著有《AI 犯罪与自我防御》(韩文),并为韩国技术教育大学(KOREATECH)在线终身教育院开发了金融科技、统计学、人工智能领域的网络课程内容。最高学位为经济学博士(东国大学,微观数理经济学)。目前在国民大学、湖西大学等多所大学讲授数据与人工智能相关课程。详细简历

课程

  • Sangsun Ahn(2025)。《面向商业的数据科学》讲义(韩文)。韩国开放网络大学(Open Cyber University of Korea)人工智能融合系。
  • Sangsun Ahn(2025)。[K-Digital] 人工智能自然语言处理(韩文)。STEP(智能职业培训平台),韩国技术教育大学在线终身教育院。
  • Sangsun Ahn(2024)。[K-Digital] 金融科技数据分析基础(韩文)。STEP(智能职业培训平台),韩国技术教育大学在线终身教育院。

STEP 课程链接:link.step.or.kr/1qyVoJ · link.step.or.kr/M9na9N · link.step.or.kr/brqEyc
如因网站改版无法正常访问,请前往 www.step.or.kr。

论文与报告

  • Sangsun Ahn(2025)。利用国民老年保障面板数据的家庭支出预测模型研究:基于人工智能模型的方法(韩文)。《未来社会》,16(2)。原文
  • Sangsun Ahn(2025)。利用国民老年保障面板数据的家庭支出预测模型研究:人工智能方法(韩文)。国民老年保障面板学术会议报告资料(2025.05.13),韩国国民年金公团国民年金研究院。报告资料
  • Sangsun Ahn(2025)。基于 SNS 文本的疑似毒品交易检测算法研究:以模式与语境分析为中心(韩文)。《未来社会》,16(1)。原文
  • Sangsun Ahn(2024)。面向金融领域异常检测模型安全的基于统计的对抗数据应对方案:实证分析与模拟结果(韩文)。《未来社会》,15(3)。原文
  • Sangsun Ahn(2024)。利用人工智能、基于虚拟角色特征的 SNS 帖子检测方案(韩文)。2024 Summer Newmedia Party 海报展示(2024.06.19),首尔媒体研究生院大学(Seoul Media Institute of Technology)。
  • Sangsun Ahn(2024)。利用工伤面板数据的机器学习模型(韩文)。第 10 届工伤保险面板学术会议海报展示(2024.05.17),韩国勤劳福祉公团勤劳福祉研究院。
  • Sangsun Ahn(2024)。虚拟资产时间序列数据的分析与预测:时间序列模型与人工智能模型的比较及改进建议(韩文)。《未来社会》,15(1)。原文

E-2 学术参考文献

  1. [R1] Berg, S., Beckett, I. R., Costa, M., … (2026). Sexual dimorphism in the complete Drosophila male central nervous system connectome. Cell, 189(18), 5504–5526. doi:10.1016/j.cell.2026.08.015 — 开头部分、“参考研究”
  2. [R2] Shiu, P. K., Sterne, G. R., Spiller, N., … Scott, K. (2024). A Drosophila computational brain model reveals sensorimotor processing. Nature, 634, 210–219. doi:10.1038/s41586-024-07763-9 — “一个神经元”、“调增益”
  3. [R3] Lappalainen, J. K., Tschopp, F. D., Prakhya, S., … Turaga, S. C. (2024). Connectome-constrained networks predict neural activity across the fly visual system. Nature, 634, 1132–1140. doi:10.1038/s41586-024-07939-3 — “三项研究比较”
  4. [R4] Plaza, S. M., Clements, J., Dolafi, T., … (2022). neuPrint: An open access tool for EM connectomics. Frontiers in Neuroinformatics, 16, 896292. doi:10.3389/fninf.2022.896292 — “参考研究”
  5. [R5] blendi-remade/fly-brain-minecraft (2026). GitHub 仓库:README、docs/REFERENCE.md、docs/VALIDATION.md、PROVENANCE.md。代码采用 MIT,连接组衍生数据采用 CC BY 4.0。github.com/blendi-remade/fly-brain-minecraft — 本篇全文(模组中的数字与验证记录)

正文脚注 [1]~ 中数字与事实的出处

编号内容数值来源
[1]模拟中的神经元、连接和突触数量176,422 / 6,287,749 / 90.3 Mfly-brain-minecraft README、PROVENANCE.md、VALIDATION.md §0(neuPrint male-cns:v1.0,仅保留 5 个及以上突触的连接)
[2]视网膜柱数、50 ms 时间步、不学习、神经元公式中的数值877 + 892 柱 · τm 20 ms · τs 5 ms · −52/−45 mV · 不应期 2.2 ms · 0.275 mV × 0.65docs/REFERENCE.md “How it works”,Shiu 等 (2024)
[3]行为观察仪表盘中的发放频率范围、活跃神经元、实时倍率表中的范围docs/VALIDATION.md §1–8(不运行游戏的自动测试,2026-09-03)
[4]增益 0.55 / 0.65 / 0.75 比较§9 表docs/VALIDATION.md §9
[5]连接组论文中的神经元数量166,700(已完成校对和注释)Berg 等 (2026) Cell 189(18):5504–5526
[6]全脑泄漏积分发放模型—Shiu 等 (2024) Nature 634:210–219
[7]在真实接线图上用深度学习训练参数的视觉系统模型64 种细胞类型,与 26 项实测研究一致Lappalainen 等 (2024) Nature 634:1132–1140 · doi:10.1038/s41586-024-07939-3
[8]两张游戏截图—fly-brain-minecraft docs/media (MIT License)

E-3 图片参考资料

  • 两张游戏截图:fly-brain-minecraft 仓库 docs/media(MIT License,© 2026 Blendi Remade / fal.ai)。Minecraft 是 Mojang/Microsoft 的商标
  • 结尾场景中的角色插图:深度学习 A to Z 实验室角色

教师 TIP

这是给讲师、企业在岗培训(OJT)负责人和辅导老师的教学指南。时间为估计值,请根据实际课堂调整。

对象已学完特别篇 1、2 的学习者;对大脑模拟和数字孪生感兴趣的从业者
先修知识特别篇 1 的 ② 感知机,特别篇 2 的“固定通路 + 学习修正”
学习目标① 用语言解释泄漏积分发放神经元的公式 ② 区分从接线图中自然出现的行为与人为制作的替身 ③ 与深度学习比较,说明几乎没有可学习连接的模型有哪些优点和局限
预计时间阅读 50~60 分钟 · 动画演示 25 分钟 · Colab 实践 30 分钟(代码 1 10 分钟,代码 2 运行 2 分钟 + 解读 15 分钟)

三种教学方案

讲授型 50 分钟

以概念为主

导入 5 分钟(游戏画面)→ 一个神经元 15 分钟 → 行为观察 15 分钟 → 真身与替身 10 分钟 → 练习题 5 分钟。

企业 OJT 90 分钟

以系统设计为主

行为观察 15 分钟 → 把“真身与替身”改写成自家系统的“模型 vs 规则”表 25 分钟 → 迁移应用 15 分钟 → 代码 2 运行与解读 25 分钟 → 提示词卡片 10 分钟。

一对一辅导

按水平分层推进

入门者只学“是什么”“一个神经元”“行为观察”。中级学习者在“一个神经元”中用公式推导出“同时需要 162 个突触”,并修改代码 1 的增益,比较发放数量。

各部分教学要点

部分停下来提问操作提示
是什么“不学习的神经网络有用吗?”先看两张游戏截图
一个神经元“输入相同,为什么脉冲出现的时刻却不同?”改变突触数和增益,观察输出发放频率
行为观察“加入苦味后,进食会在哪个阶段停下?”按“糖 → 糖 + 苦味”的顺序点击
调增益“为什么 0.75 就会失控?”比较 0.65 和 0.75 的梳理曲线图
真身与替身“出现 [REFLEX] 时,是谁在驾驶?”重看苹果气味场景
三项研究比较“右上角(真实接线图 + 学习)会是什么?”指出地图上 Lappalainen (2024) 那个点
实践:训练器“只学习 483 个连接,能答对百分之多少?”交替训练固定接线脉冲网络和 MLP

常见误解 Top 5

误解正确解释要展示的画面
只要有连接组,就能完整复现大脑其中缺少神经调质、电突触以及各神经元不同的特性。气味通路已饱和,由替身接管“真身与替身”中的局限列表
游戏里的果蝇会学习可学习的权重为 0 个。人为设定的只有增益 0.65 等少数几个值开头数字、调增益
发放频率数字是真实果蝇的数值这些是模型的测试结果,不要相信绝对值,只看规律行为观察中的浅色带
涌现出的行为已通过真实果蝇实验验证这是模型内部的结果。只有部分通路在其他研究中通过动物实验得到证实“真身与替身”中关于“涌现”范围的段落
脉冲神经网络无法学习机器学习中可以用替代梯度来训练。这个模组不学习,是设计上的选择结构比较、代码 2

练习题(点击展开解析)

Q1. 一个含 30 个突触的连接,每来一个输入脉冲增加的电流 g 是多少 mV?(0.275 mV × 增益 0.65)

30 × 0.275 × 0.65 ≈ 5.36 mV.

Q2. 静息电压 −52 mV、阈值 −45 mV。如果一次脉冲使膜电压升高约 g 的 0.1575 倍,那么要单独触发发放,g 需要多大?

距阈值 7 mV。7 / 0.1575 ≈ 44.4 mV。增益为 1.0 时需要约 162 个突触同时作用,增益为 0.65 时需要约 249 个。

Q3. 在“糖 + 苦味”场景中,口器运动神经元(MN9)为 0 Hz,而甜味二级神经元仍处于激活状态。抑制发生在哪个阶段?

运动之前的最后一步。苦味刹车(Scapula)阻断了进食指令通路。

Q4. 把增益提高到 0.75,梳理场景中会发生什么?

仅 200 ms 内,每个时间步的脉冲数就膨胀到五倍,Kenyon 细胞以 39 Hz 被唤醒,由此产生的抑制甚至关掉了梳理指令神经元(失控)。

Q5. 在代码 2 中,固定接线的脉冲模型只学习 644 个连接,测试准确率达到 0.75~0.81。与 MLP(16,708 个,0.88~0.91)相比,该如何解读这一结果?

只学习约 4% 的连接就能答对不少,但由于无法学习表示本身,准确率低于 MLP。还应指出数据很少(测试 32 个),差异会有 ±0.1 的波动。

Colab 作业

基础

在代码 1 中把增益 0.65 改为 0.55 和 0.75,用表格报告发放的神经元数量和平均发放频率,并结合“调增益”一节中的失控现象,用两句话加以解释。

挑战

在代码 2 的 ConnectomeLIF 中,把抑制神经元的符号(−0.5)全部改为 +0.18(去掉抑制)后重新训练。用两个随机种子比较脉冲记录(第 8 格)和准确率,并说明抑制在神经网络中起什么作用。

难度调整与延伸学习

入门者“一个神经元”中的公式只读“用语言读”部分即可。重点掌握“行为观察”和“真身与替身”
进阶让学生调研像 Lappalainen 等 (2024) 那样在接线图上只学习部分参数的方法并做报告。调研的论文要查阅原文确认
延伸学习Sangsun Ahn,《面向商业的数据科学》讲义(数据科学概论,韩文)· STEP [K-Digital] 人工智能自然语言处理 · STEP [K-Digital] 金融科技数据分析基础
讲师用资料练习题的评分标准和作业参考答案见教师用答案页面(特别篇 3)

辛苦啦!

你已经读完了《特别篇 3 Minecraft 里的果蝇大脑》。实验室的成员们各自来做个总结。

博士
博士我们把一只不学习、只靠接线图行动的果蝇从头看到了尾。
  • 约 17.6 万个神经元不经学习,只按“突触数 × 0.275 mV × 增益 0.65”运行
  • 尝到糖时口器运动神经元以 30–90 Hz 激活,这是从接线图中产生的
  • 只有 644 个可学习连接的固定接线模型,测试准确率达到 0.75~0.81
助手
助手追踪气味居然还得靠人替它开车!
果蝇研究员
果蝇研究员游戏里有我耶?要是比我飞得还好可就麻烦了。
研究机器人
研究机器人分析完毕。直接使用接线图时,需要学习的权重为 0 个。